Compilar ficheros de Cython es más fácil usando la función cythonize dentro del setup.py de nuestro proyecto:

# File: setup.py

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
      name = "My hello app",
      ext_modules = cythonize('fibonacci.pyx'), # accepts a glob pattern
)

Por ejemplo, el fichero a compilar es fibonacci.pyx, que contiene un ejemplo del tutorial de Cython:

# File: fibonacci.pyx

def fib(n):
    a, b = 0, 1
    while b < n:
        print b,
        a, b = b, a + b

El resultado de compilar fibonacci.pyx es un fichero con código intermedio en C fibonacci.c y un fichero compilado fibonacci.so.

$ python setup.py build
running build
running build_ext
building 'fibonacci' extension
/usr/bin/clang ...snip... -o build/lib.macosx-10.8-x86_64-2.7/fibonacci.so

note

El compilador que se utiliza es el que sea por defecto del sistema en ese momento. Aún estoy investigando cómo seleccionar un compilador en concreto, o añadir librerías y flags.

El fichero .so puede usarse desde otros módulos de Python, o directamente desde la shell

>>> import fibonacci
>>> fibonacci.fib(5)
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